我之所以来这里讲是想大家能听到一些些东西,也许大家来这里的目的也是如此,很多人也许是为着生物信息学这个题而来的。
在开始讲座之前,我想先讲一个故事,在北大燕南园是最好的地方,我是住在燕北园,但是就在年初,确切地说是在2000年2月2日,春节前两天,燕北园实现了光纤入网,光纤入网的概念是每秒10兆,当我把这个消息告诉我在美国、英国的朋友时,他们的回复是“excellent”我想这对于用modem上网的人来说是值得羡慕的。
生物信息学的英文名是bioiformatic,我们先从生物学谈起,从生物圈到生态系统到动物到器官到细胞,分子再到原子,基本粒子是生物学的基本线索,生物学的主要研究范围集中在器官,细胞,分子叫分子生物学,细胞分裂是延续后代的基本方法,通过紫色体的一分为二实现遗体信息的传递,基本信息是:细胞—细胞核—染色体—基因—碱基。人类有23对染色体,其中一对是X、Y染色体。DNA是遗传密码的携带者,通过DNA的复制把信息传给下一带。
中心法则告诉我们,信息从DNA传给RNA,再传给蛋白质,实现功能,DNA的代码有四种,而蛋白质的代码有20多种,复杂得多,因为它是功能的实现者。
目前,人类正在进行基因组计划,即基因测序,已完成的原核生物有27,正在进行的有114;已完成的真核生物有3(39),正在进行的311927,目前,有两大机构在从事这一计划,一家是由政府出钱,请科当家做,把最新科研成果分布到网上,使所有人使用,另一家是公司在做,有相当先进的设备和人员,这引起了一系列争执,政府部门要求公司也将其信息分布。
例如现在对大肠杆菌基因组的400多万个碱基的测序,就已完成,然后把它存入计算机,从而做成分子生物信息数据库,当你进入数据库你就可以亨用信息了。
生物进化在于分子水平上的提高,通过时鱼类,两栖类,爬行类,鸟类,哺乳类胚胎发育的考察,是一个动态调控制过程,调控基因的信息未知,需要在知大量基因密码的基础上搞清。
目前基因工程主要用于基因药物。
分子生物信息的开发和利用:
以核酸蛋白质等生物的分子为主要研究对象
以信息数理、计算机科学为主要研究手段
以计算机网络为主要研究环境
以计算机软件为主要研究工具
分子生物信息研究:解决理论问题
阐明细胞器官和个体的发生、发育、源泉
衰亡的基本规律和时空联系,最后建立生物学周期表,“探索生物起源,生物进化,生命本质等重大理论问题”。
数据→信息→知识→理论
国际著名的生物信息中心:NCBA(US)、EBI
欧洲分子生物学网络组织(EMBnet):
由欧盟出钱,为世界各国提供生物信息资源
EMBnet+国家节点(29个)+专来节点(8个)
亚太生物信息学网络组织(APBionet):刚起步
863计划生物信息数据库
承担课题:863生物领域、211计划等
国际合作和联系:NCBI、EBI等
生物信息资源:生物信息资源镜象(10个)
蛋白质分析专家系统
生物信息数据查询系统
构建二次数据库:转录因子细胞特异性数据库
中华民族基因多态性数据库
水稻矮病基因
国家生物信息中心:
结束语:I think we can not get a Nobel prize, by what we are doing, but the Nobel prize winners know what we are doing for, so I will go to my death with smile.